Метеоспостереженя за програмою другого розряду в місті Жмеринці почали у 1887 році, в складі південно-західній мережі, якою керував А. В.Клоссовський.

У 1890 році на станції Жмеринка, в 4 км на південний схід від попереднього місця, спостереження організовано Управління Південно-Західної залізниці.

В роботі станції були перерви з 1908 по 9 вересня 1924 року і 15 липня 1941 року до 15 вересня 1942 року.

​За час свого існування, станцію двічі переносили: 18 жовтня 1939 року на 1,6 км на південний схід, та в 1942 году на 1,5 км на північно-захід, 21 квітня 1944 року станція повернена на довійськове місце на території залізничного лісорозсадника, при чому, висота її незначно змінювалася.

До 1907 року на установці була будка Вільде. У 1924 році встановлено плювіограф, в 1940 році-гідрограф. 31 серпня 1950 року встановлено опадомір Третьякова.

11 грудня 1957 року почали спостереження за флюгером з важкої дошкою.